Convertir vídeo

---ogg a avi---
mencoder -idx input.ogg -ovc lavc -oac mp3lame -o output.avi
---ogg a flv---
mencoder -idx out.ogg -ovc lavc -oac mp3lame -o video.flv
# Cambia input por el nombre de tu archivo ogg y output por
el nombre del archivo de salida avi o flv
---vob a mpg o mpeg---
Cambia la extensión de .vob a .mpg o .mpeg, el fichero es legible y sigue teniendo toda la información, aunque algunos visualizadores no soportarán las pistas de subtítulos
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Instala el ffmpeg, luego, ve a donde se encuentra el ".vob" y escribe lo siguiente:
ffmpeg -i archivo.vob archivo.avi
y así obtienes tu ".avi"
si quieres unir varios avis, instalas el transcode y escribes:
avimerge 1.avi 2.avi > 1_2.avi
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---mov a avi o mpeg---
mencoder -oac mp3lame -srate 22050 -ovc lavc -lavcopts vcodec=mjpeg -vf scale=680:544 archivo.mov -o video_nuevo.avi
"680:544" lo reemplazas por el valor que obtienes en las propiedades de tu video ".mov" en "sonido y video/dimensiones"
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**Ver este excelente "Cómo"**
CÓMO pasar de .avi a dvd con menús usando SOFTWARE LIBRE
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Ahora también puedes usar una GUI para ffmpeg: WinFF
WinFF convierte casi cualquier archivo de vídeo que FFmpeg puede convertir.
WinFF crea varios archivos en múltiples formatos al mismo tiempo.
Repositoriosdeb http://ppa.launchpad.net/paul-climbing/ubuntu hardy main
deb http://ppa.launchpad.net/paul-climbing/ubuntu intrepid main

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Modificado 9 de enero de 2018:

mkv a mp4

avconv -i input.mkv -codec copy output.mp4

Fuente: https://askubuntu.com/a/667773